Plateau de phénotypage

Plateau de phénotypage

Créée en 2012 dans le cadre du projet d'infrastructure TEFOR, notre plateforme de phénotypage du poisson zèbre est située sur le campus de l'Inra de Jouy-en-Josas dans l'environnement du plateau de Saclay. Depuis 2018, elle est rattachée à l'infrastructure nationale d'infectiologie "EMERG'IN" pour le contrôle des maladies infectieuses émergentes, animales et zoonotiques. Dans ce contexte, la plateforme propose des services liés à l’utilisation du poisson zèbre comme modèle in vivo pour l’étude de pathologies infectieuses et inflammatoires notamment par des approches d’imagerie dynamique. Idéalement localisée au sein de la pisciculture, la plateforme est équipée de deux postes de microinjections (situés en laboratoire conventionnel et en laboratoire confiné) et d’un microscope deux photons au sein d’une zone BSL2 pour permettre le suivi en temps réel des processus infectieux de la larve au poisson adulte.

Expertises

  • développement de modèles zebrafish pour des pathologies infectieuses (zoonose, virus humains ou animaux) et ou inflammatoire
  • immunohistochimie /transparisation (CUBIC; iDISCO+,...)
  • microscopie 3D/3D+t sur tissus épais: confocale ou deux photons
  • analyse d’images (reconstruction/visualisation 3D, segmentation, tracking,...)
  • approches d’édition de genome en zone saine (injections de morpholino et de cDNA)
  • expérience en milieu BSL2 (injections de pathogènes)

 

Equipements                                                                            

  • imagerie in vivo
    • stéréomicroscopes MZ10F
    • SP8 DM6000 confocal, 2P laser fs (Leica, Coherent) équipé d'une chambre thermostatée
    • imagerie à bioluminescence IVIS SpectrumBL (Perkin Elmer)
  • cytométrie en flux d'objets pour le tri et l'analyse d'embryons de poissons zèbre et d'organoides (diamètre max. 200-700mm) COPAS FP-1000, (Union Biometrica)
  • suivi comportemental des espèces poissons 
    • Viewpoint ZebraCube et ZebraBox
    • système Home made  
  • microscope à feuille de lumière Benchtop MesoSPIM avec 3 lasers (488 nm, 561 nm, 638 nm), camera sCMOS, double faisceaux d' illumination, détection horizontale, ASLM et chambres d'acquisition adaptées à des échantillons de taille variable, transparisés dans différents milieux,

 

L'équipe : 

Christelle Langevin : directrice de l'unité et responsable de l'équipe 

Maxence Frétaud : ingénieur d'études

Manon Mehraz : ingénieure d'études